miRNA-494-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息分析

目的采用生物信息学的方法对miRNA-494-3p的靶基因进行预测,并对靶基因集合进行功能富集分析和信号通路分析。方法应用微小RNA(miRNA)靶基因数据库StarBase进行靶基因预测,选取miRanda、PITA和Targetscan 3个数据库预测结果的交集作为进一步分析的基因集合。利用DAVID数据库,对靶基因进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果3个数据库预测到miRNA-494-3p的靶基因253个,其功能分别富集在蛋白质结合、双链DNA结合、RNA结合等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、细胞增殖的正调控、细胞分化、细胞凋亡等生物学过程以及细胞核、核质、胞浆、细胞质、细胞隔膜等细胞组分上;生物学通路主要富集于癌症通路、FoxO信号通路、细胞吞噬作用、刺猬信号通路、细胞黏附连接、肌动蛋白细胞骨架的调控、谷氨酸能突触、昼夜节律以及p53信号通路中。结论miRNA-494-3p的功能主要富集在与癌症、胰岛素抵抗、糖尿病、炎症、胚胎发育等相关的多个信号通路中,为进一步研究其对靶基因和信号通路的调控作用及其可能的机制提供了线索。     

创富路上桂花香

曹升剑自称自己是桂花镇的业余农民,他的桂花基地就在桂花镇白沙村的马路边,一棵树龄80年的古桂是最显眼的招牌。秋收后的田野满目枯黄,路边桂花基地内却仍是一片绿意。大到绿得发黑的老年古桂,小到才吐新绿的桂花细苗,争着展现桂花树的青春美态。三年前,这里还一片荒芜;现在,地里的桂花苗木能卖30万元。回想创业经历,30多岁的曹升剑脸上溢满自豪的微笑。1995年,曹升剑从咸宁林校毕业后到广东打了两年工,之后就回到桂花镇林业站上班。在农民看来,曹升     

北疆地区天然气供应情况统计分析

2012年乌鲁木齐市实施煤改气工程后西部管道公司在北疆地区,特别是乌鲁木齐市的天然气供应量大幅增加。给公司在北疆天然气供应方面带来一定的压力,本文通过对公司北疆地区各类用户天然气供应量的统计和分析,得出北疆地区各类天然气用户消费规律,统计分析结果对公司北疆地区天然气供应和管道生产运行具有一定的参考意义。