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| 点带石斑鱼神经坏死病毒基因组分析 | |
| 引用本文： | 龚艳清,彭智发,陈信忠,朱昌福,徐淑菲.点带石斑鱼神经坏死病毒基因组分析[J].检验检疫科学,2007,17(1):10-15. |
| 作者姓名： | 龚艳清 彭智发 陈信忠 朱昌福 徐淑菲 |
| 作者单位： | 1. 厦门出入境检验检疫局,福建厦门,361012 2. 福建农林大学,福建福州,350002 3. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300 |
| 基金项目： | 国家质量监督检验检疫总局科研项目 |
| 摘 要： | 目的]准确诊断发生在福建南部点带石斑鱼育苗场的鱼病.方法]根据基因库中已报告的石斑鱼NNV核苷酸序列,设计了8对特异性引物,用于扩增点带石斑鱼NNV的RNA1和RNA2特定片段.PCR扩增产物经琼脂糖电泳确认后进行核酸测序,用相应软件进行拼接,得到点带石斑鱼NNV基因组全序列.用DNAstar软件对该序列进行分析,得到相应的氨基酸序列.结果]该病毒的RNA1含有一个编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependant RNA polymerase,RdRp)的开放阅读框(ORF)为2949nt,编码1个由982个氨基酸组成的蛋白质;RNA2的ORF为1017nt,编码1个由338个氨基酸组成的病毒主衣壳蛋白.将这些核苷酸序列以及推导的氨基酸序列与基因库中同属于罗达病毒科(Nodaviridae)的其他罗达病毒进行同源性比较,该病毒与其他已知的石斑鱼NNV的同源性高.系统发育进化分析也表明,点带石斑鱼NNV与其他石斑鱼NNV亲缘关系很近,同属于赤点石斑NNV血清群,与其他β罗达病毒有一定的距离,与α罗达病毒则有明显的不同.结论]福建南部个别点带石斑鱼育苗场的石斑鱼感染了神经坏死病毒. |
| 关 键 词： | 点带石斑鱼 神经坏死病毒 基因组分析 点带石斑鱼 神经 坏死 病毒 基因组分析 Epinephelus GROUPER CULTURED VIRUS NECROSIS NERVOUS ANALYSES 感染 距离 血清群 赤点石斑 亲缘关系 进化分析 系统发育 同源性比较 |
GENE ANALYSES OF THE NERVOUS NECROSIS VIRUS IN CULTURED GROUPER Epinephelus Malabaricus |
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| GONG Yanqing,PENG Zhifa,CHEN Xinzhong,ZHU Changfu,XU Shufei.GENE ANALYSES OF THE NERVOUS NECROSIS VIRUS IN CULTURED GROUPER Epinephelus Malabaricus[J].Inspection and Quarantine Science,2007,17(1):10-15. | |
| Authors: | GONG Yanqing PENG Zhifa CHEN Xinzhong ZHU Changfu XU Shufei |
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