增值税进项税票超过抵扣期限的处理

我公司的一家子公司在2004年8月16日给一客户开具了金额为3945万元的增值税普通发票，后又于2004年8月19日开具了金额为105万元的增值税普通发票。由于客户名称变更，要求我方重新开发票。我方于2006年11月24日在收到对方退回的原发票同时，当天开具了新的发票，金额为499.5万元。