基于网络药理学分析中药广藿香抗菌作用机制和关键靶点

目的 探讨中药广藿香主要活性成分的抗菌作用机制和关键靶点。方法 首先从中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库中筛选出中药广藿香的主要有效成分及相应作用靶点,运用Uniprot数据库将其转化成相应的靶点基因,接着将经过筛选得到的广藿香主要活性成分与靶点基因导入至Cytoscape3.6.1软件中,绘制出广藿香主要活性成分-基因靶点网络图。结合Gene Cards数据库对广藿香发挥抗菌作用的相关靶点进行检索,随后将筛选得到的核心靶点基因上传至STRING平台,进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建,最后,应用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果 从广藿香中筛选出11个主要活性成分,可能的抗菌作用靶点1839个,包括AKT1、IL6、VEGFA、CASP3和JUN等。经PPI网络分析可以发现广藿香的主要活性成分与抗菌靶蛋白之间结合能力较强。通过对靶点的GO分析和KEGG通路富集分析可以发现生物过程模块主要参与对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、对营养水平的反应、氧化应激反应等过程;分子功能模块主要参与细胞因子受...     

欧盟转基因生物——安全立法和管理情况

转基因生物（包括微生物）是指通过人工基因工程或DNA重组技术,而不是通过自然配对法,使遗传物质从一个生物体转移到另一个生物体,这种转移可以在不同物种之间进行。２０世纪８０年代以来,随着现代分子生物学和生物技术,特别是基因工程技术的迅猛发展,转基因生物的研究开发和利用也得到了前所未有的发展。但是,由于转基因生物是通过人工基因工程技术把一种生物体的基因转移到另一种生物体中。因此,转基因生物释放到自然环境中后,可能会发生基因转移,对环境、人类的健康和物种演化会产生潜在的危险,而这种潜在的危险往往在短期…     

生物技术纺织品

圣地亚哥蛋白质聚合物技术研究已开发了能使粗糙的羊毛或粗麻布具有丝绸柔软性的人工基因。其原理是当基因被植入合适的细菌中,该细菌会产生丝一样的聚合物,然后该聚     

都市圈要素流动网络中节点核的界定及链接作用研究

基于微观企业间关系的层面,研究都市圈要素整合过程中如何判定核心企业及其在网络链接过程中所起到的作用。认为核心企业是处于都市圈要素流动网络关键位置的节点核,并运用节点的强度、强度分布以及相互关系、加权的聚类系数等参数体系来对节点核进行判别,这种判别方法考虑了节点的绝对权重和相关权重。最后,以徐州都市圈内典型产业的发展为例,总结了区域内节点核产生的4种途径,分析了节点核促进产业衍生、控制价值链、产生知识溢出、提高产业竞争力的中介作用。     

发展转基因作物面临的问题与对策

现代生物技术的发展使人们能够知道生物体内某一基因对特定性状或产物的决定关系。转基因作物就是将来自某一植物或微生物,甚至是动物的一段遗传物质(DNA)转移到另一不同的植物中,使人们所希望的生物性状或产物在后者的生产中得以表达。 　　目前主要有两个途径来进行农作物的转基因操作。一个是“农杆菌”,一个是“基因枪”。农杆菌途径是以被称为自然界的天然遗传工程师的农杆菌作为载体,将目的基因导入要改造的农作物。原先普遍认为这种转基因的方法只适用于阔叶植物,但最近已在谷类植物的转导方面取得了很大进展。这种途径的优点是手段相对简单,可以在具备组织培养条件的任何实验室进行,缺点是易发生遗传物质的意外转导及活体转导菌对环境产生影响。基因枪途径是将目的基因包裹上金或钨粉做成现代生物技术的发展使人们能够知道生物体内某一基因对特定性状或产物的决定关系。转基因作物就是将来自某一植物或微生物,甚至是动物的一段遗传物质(DNA)转移到另一不同的植物中,使人们所希望的生物性状或产物在后者的生产中得以表达。……     

选择性遗传标记亲本细胞的培养及鉴别

在酵母中，呼吸缺陷型突变是经常遇到的。在平皿分离中，会长出约1％的小菌落，这些小茵落丧失呼吸能力。产生这种变异大部分是细胞质基因发生突变，但有时核基因也会突变成小菌落。小菌落突变后，对非发酵型物质如甘油、乙醇、醋酸等不能氧化，但二氧化碳放出高于对照株，酒精脱氢酶活力较对照亦高出1倍左右，对提高酒精产率有好处。本实验用化学诱变方法获得乳白色呼吸缺陷型小茵落，为后续受体原生质体融合育种提供稳定遗传标记菌株。     

miRNA-494-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息分析

目的采用生物信息学的方法对miRNA-494-3p的靶基因进行预测,并对靶基因集合进行功能富集分析和信号通路分析。方法应用微小RNA(miRNA)靶基因数据库StarBase进行靶基因预测,选取miRanda、PITA和Targetscan 3个数据库预测结果的交集作为进一步分析的基因集合。利用DAVID数据库,对靶基因进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果3个数据库预测到miRNA-494-3p的靶基因253个,其功能分别富集在蛋白质结合、双链DNA结合、RNA结合等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、细胞增殖的正调控、细胞分化、细胞凋亡等生物学过程以及细胞核、核质、胞浆、细胞质、细胞隔膜等细胞组分上;生物学通路主要富集于癌症通路、FoxO信号通路、细胞吞噬作用、刺猬信号通路、细胞黏附连接、肌动蛋白细胞骨架的调控、谷氨酸能突触、昼夜节律以及p53信号通路中。结论miRNA-494-3p的功能主要富集在与癌症、胰岛素抵抗、糖尿病、炎症、胚胎发育等相关的多个信号通路中,为进一步研究其对靶基因和信号通路的调控作用及其可能的机制提供了线索。     

选择性遗传标记亲本细胞的培养及鉴别

在酵母中,呼吸缺陷型突变是经常遇到的.在平皿分高中,会长出约1%的小菌落,述些小菌落丧失呼吸能力.产生这种变异大部分是细胞质基因发生突变,但有时核基因也会突变成小菌落.小菌落突变后,对非发酵型物质如甘油、乙醇、醋酸等不能氧化,但二氧化碳放出高于对照株,酒精脱氢酶活力较对照亦高出1倍左右,对提高酒精产率有好处.本实验用化学诱变方法获得乳白色呼吸缺陷型小苗落,为后续受体原生质体融合育种提供稳定遗传标记菌株.     

生物经济时代未到基因战争拉开帷幕(下篇)

推广转基因粮食可能会产生毁灭性灾难 基因漂移难以避免 同种植物,通过花粉扩散,可以产生基因漂移或污染.很多年前就有报道称美国曾追回出口的300万吨玉米,因为这些玉米受到了特供药厂制药所用的转基因玉米的污染.     

抗除草剂的甜菜

比利时植物遗传系统公司的科学家已将一个从链霉菌中分离出的基因插到甜菜的细胞中,该基因的表达可促进生产一种酶——磷基麦黄酮乙酰转移酶,可使除草剂磷基麦黄酮失去活性。     

基于网络药理学与分子对接分析都梁丸抗偏头痛的作用机制

目的运用网络药理学方法与分子对接技术探讨都梁丸抗偏头痛的分子作用机制。方法依据反向药效团匹配方法预测活性成分靶点信息,通过DrugBank、GeneCards、NCBI数据库对比筛选抗偏头痛靶点,通过Rv 3.5.1软件进行潜在靶点基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络图,通过String数据库获取蛋白相互作用,用Systems dock Web Site对其进行分子对接验证。结果网络药理学分析结果表明都梁丸中的活性成分可通过干预22个潜在靶点和调节肾素-血管紧张素系统、胰岛素抵抗、MAPK信号通路发挥抗偏头痛作用。分子对接结果中dockingscore>4.25占76%,说明活性成分与靶点之间有一定的结合活性。结论都梁丸可能通过“多成分-多靶点-多通路”调控MME、肾素-血管紧张素系统、激素受体等发挥抗偏头痛作用。     

基因人的伦理问题

作为生物科技为主导的新时代,基因技术是引无数科学家感兴趣的研究领域,他们不断将手伸向了对基因的改造上,随着转基因食品的广泛出现,再到未来某天基因人的诞生,这一切都是顺理成章的事.但是,同时也会带来一系列的伦理问题,引发人们的伦理思考.一旦"基因人"的出现,必将面临一系列来自社会伦理道德方面的巨大挑战,目前的普遍看法是,人类在基因技术如何影响人类社会传统道德方面的研究远远落后与基因技术本身的演绎.实际上,许多科学的新发现都伴随着对伦理道德的冲击和影响,这是一个老话题.对于人类的进化或优化过程而言,技术应该只是手段,在没有获得充分的依据表明其从根本上不会对人类的发展构成威胁或伤害的情况下,在没有对该技术的社会伦理后果做出有效的预估的情况下,切忌就加以应用和推行.本人主要分为三个部分,第一部分阐释了与基因人相关的概念,比如何为基因和基因技术,正是有了基因技术的催化作用才为基因人的诞生提供了必要条件.第二部分归纳总结了基因人产生会触及到的伦理学问题,尤其是对生命伦理学和社会伦理学领域产生了深刻的影响.第三部分解释了随着"基因人"的产生,基因伦理的社会价值尤其应引人注意.基因人的伦理问题不是只供人泛泛之谈,而是需重视和落实于行动,发挥伦理学对于科技的规范指引作用,客观上也是促进基因伦理学的新发展.     

法国政府消除公众“核恐惧”的做法

自50年代初期,法国政府就确定了优先发展核能的战略,并率先在欧洲国家中大量利用核能发电。使核发电占据法国总发电量的80％。正在运行中的56座核电站,加上军用核设施以及民用核研究等,每年大约产生3万立方米,约6.5万吨放射性垃圾。核发电以及与核     

活性材料的研究与发展

一些聚合物、陶瓷或合金处在电流、电磁场或温度变化的条件下会产生机械动作,如用于医疗中的遥控微电机、核电站中缓冲接触件或潮汐发电设备中特殊元件所使用的材料,这些材料统称为活性材料。导电聚合物也是其中之一,尽管它只能保证电荷的传输,但可用在钮扣电池中或作为保护信息材料的屏蔽物使用。另一种聚合物像聚胺酯具有形状记忆功能。日本人用其制成玩具娃娃,在给娃娃洗澡时,她能根据水的温度改变面貌,日本人由此     

多伦多科学家揭开免疫系统之谜，找到免疫系统开关

多伦多玛格利特公主医院彭林格博士领导的研究小组日前获得一项重大突破，发现 CD45基因具有关闭免疫系统功能的特质。 CD45是调节红白血细胞生长、病毒感染和一系列疾病的关键基因蛋白。这种类似开关的基因在免疫系统对病菌或病毒产生足够抵抗力之后会适时关闭免疫系统，以阻止免疫系统对健康细胞产生杀伤，从而阻止癌症、糖尿病和心脏病的发生。 　　这项研究成果已在 2001年 1月 18日出版的《自然》科学杂志上发表。 　　研究小组由来自玛格利特公主医院的安省癌症研究所、多伦多总医院和附属于多伦多大学的半私立研究机构奥姆金研究所…     

核电,放弃还是发展?

<正>早在2011年日本福岛核事故发生之后,德国政府就宣布在2022年之前关闭所有的核电站,彻底放弃核应用。德国弃核引起了全世界对于核电技术的关注,而放眼各国,目前世界上还存在着挺核与弃核两大阵营。确实,核电技术本身具备的潜在高风险性,使得各国在和平利用核能的过程中产生了诸多顾虑。就目前世界各国的新能源发展情况看,替代核能应用的电力尚不能     

基于网络药理学探讨葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制

目的运用网络药理学方法揭示葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取葛根芩连汤有效成分及活性成分作用靶点;运用GeneCards数据库获取放射性肠炎疾病基因;将靶点和靶标基因取交集,获得关键靶点,用String数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。运用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共收集葛根芩连汤138个活性成分和8个关键作用靶点。GO富集分析和KEGG通路富集分析其主要机制是通过调控黏附斑激酶(FAK)及其信号通路,MAPK信号通路等信号通路,调节Th17细胞分化在放射性肠炎损伤修复中发挥损伤修复作用。结论葛根芩连汤治疗放射性肠炎可能影响了放射性肠炎的免疫微环境,并调控肠道炎症反应起到治疗作用。     

科学本质的伦理思考

一、科学产生的伦理基因对科学的本质进行伦理思考的积极意义就在于从历史的角度去考察科学活动伦理价值的渊源.所以,我们首先追溯科学产生的伦理基因.在这里,旨在说明伦理的价值取向是科学产生动因的一部分,并非全部.沿世界科学史溯流而上,科学的源头可以分为二股,其一为以古希腊为代表的西方科学,其二为以古代中国为代表的东方科学.1、西方科学产生的伦理基因.在古希腊,人们超越了原始神灵膜拜与迷信之后逐步形成了对自然,对人,以及对人与自然的关系全面系统的观念,构成了古代朴素辩证的、天人合一的自然观,科学便产生在这种自然观中.西方科学是建构在自然的根基之上的,但探讨人类社会和人本身依然占科学研究的很大比重.普罗泰哥拉斯认为“人是万物的尺度”,这种观点在一定程度上反映出     

CYP2D6和CYP3A5基因多态性联合检测提高利培酮临床疗效的研究

目的探讨CYP2D6和CYP3A5基因多态性联合检测对提高利培酮临床疗效的研究。方法选取2017年5月至2018年5月在营口市第四人民医院精神科接受诊治的精神分裂症患者83例为研究对象,应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术检测CYP2D6和CYP3A5基因多态性,采用液相色谱法检测血浆利培酮与9-羟基利培酮的浓度。结果血浆利培酮、9-羟基利培酮与总活性产物在CYP2D6*10/*10基因型中的浓度分别为(243±36)ng/ml、(290±35)ng/ml和(532±68)ng/ml,均明显高于*1/*1和*1/*10,差异均有统计学意义(均P<0.05)。CYP3A5*3/*3基因型中9-羟基利培酮的浓度为(317±42)ng/ml,明显高于*1/*1与*1/*3,差异有统计学意义(P<0.05)。Spearman相关分析显示,血浆利培酮、9-羟基利培酮、总活性产物和CYP2D6*10/*10呈明显正相关(r=0.756、0.773、0.812,P<0.001),血浆9-羟基利培酮与CYP3A5*3/*3呈明显正相关(r=0.743,P<0.05)。血浆利培酮、9-羟基利培酮与总活性产物在*3/*3且*10/*10基因组中均明显高于单一*3/*3或*10/*10,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论 CYP2D6和CYP3A5不同基因型影响血浆利培酮的代谢,二者联合检测可以为利培酮个体化用药提供指导。     

试揭商品经济的基因之谜

关于商品经济产生和存在的原因,理论界的探讨和争论已是旷日持久的了。由于人们的着眼点不同,因此所得结论也各异。但如果在众多的原因中不能找到一种决定商品经济产生和存在的本质的、最根本的原因——即商品经济的基因,那是无助于问题的引深的,也无助于商品经济的发展、运行和调控等问题的进一步解决。因此,探索商品经济的基因之谜,乃是研究整个商品经济问题的重要关键。