基于网络药理学分析中药广藿香抗菌作用机制和关键靶点

目的 探讨中药广藿香主要活性成分的抗菌作用机制和关键靶点。方法 首先从中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库中筛选出中药广藿香的主要有效成分及相应作用靶点,运用Uniprot数据库将其转化成相应的靶点基因,接着将经过筛选得到的广藿香主要活性成分与靶点基因导入至Cytoscape3.6.1软件中,绘制出广藿香主要活性成分-基因靶点网络图。结合Gene Cards数据库对广藿香发挥抗菌作用的相关靶点进行检索,随后将筛选得到的核心靶点基因上传至STRING平台,进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建,最后,应用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果 从广藿香中筛选出11个主要活性成分,可能的抗菌作用靶点1839个,包括AKT1、IL6、VEGFA、CASP3和JUN等。经PPI网络分析可以发现广藿香的主要活性成分与抗菌靶蛋白之间结合能力较强。通过对靶点的GO分析和KEGG通路富集分析可以发现生物过程模块主要参与对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、对营养水平的反应、氧化应激反应等过程;分子功能模块主要参与细胞因子受...     

基于网络药理学探讨葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制

目的运用网络药理学方法揭示葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取葛根芩连汤有效成分及活性成分作用靶点;运用GeneCards数据库获取放射性肠炎疾病基因;将靶点和靶标基因取交集,获得关键靶点,用String数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。运用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共收集葛根芩连汤138个活性成分和8个关键作用靶点。GO富集分析和KEGG通路富集分析其主要机制是通过调控黏附斑激酶(FAK)及其信号通路,MAPK信号通路等信号通路,调节Th17细胞分化在放射性肠炎损伤修复中发挥损伤修复作用。结论葛根芩连汤治疗放射性肠炎可能影响了放射性肠炎的免疫微环境,并调控肠道炎症反应起到治疗作用。     

基于网络药理学探讨桃仁-红花药对治疗膝骨性关节炎的作用机制

目的基于网络药理学的研究方法,探讨桃仁-红花药对治疗膝骨性关节炎(KOA)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards、OMIM等数据库检索药物、疾病的共同作用靶点,制作韦恩图;利用String数据库构建药物与疾病共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape3.7.2软件构建药物-成分-疾病-靶点网络;最后通过Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并将结果可视化。结果桃仁-红花药对治疗KOA的主要成分是槲皮素、beta-谷甾醇、山奈酚、木犀草素、黄芩素等;关键靶点为IL6、MAPK8、IL1B、MAPK1、JUN、VEGFA、PTGS2、CCL2、EGF、MMP2等;关键作用通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路、恰加斯病、肿瘤坏死因子信号通路、癌症的途径、HIF-1信号通路等。结论桃仁-红花药物有效成分通过多靶点,多通路产生抑制KOA内的炎症反应、成骨细胞的表达、软骨细胞凋亡等作用,进而达到治疗KOA的目的。     

基于网络药理学与分子对接分析都梁丸抗偏头痛的作用机制

目的运用网络药理学方法与分子对接技术探讨都梁丸抗偏头痛的分子作用机制。方法依据反向药效团匹配方法预测活性成分靶点信息,通过DrugBank、GeneCards、NCBI数据库对比筛选抗偏头痛靶点,通过Rv 3.5.1软件进行潜在靶点基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络图,通过String数据库获取蛋白相互作用,用Systems dock Web Site对其进行分子对接验证。结果网络药理学分析结果表明都梁丸中的活性成分可通过干预22个潜在靶点和调节肾素-血管紧张素系统、胰岛素抵抗、MAPK信号通路发挥抗偏头痛作用。分子对接结果中dockingscore>4.25占76%,说明活性成分与靶点之间有一定的结合活性。结论都梁丸可能通过“多成分-多靶点-多通路”调控MME、肾素-血管紧张素系统、激素受体等发挥抗偏头痛作用。     

基于网络药理学探索黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的 运用网络药理学探讨黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的主要有效成分,预测有效成分的作用靶点,建立"中药-成分-靶点-疾病"网络,再深入研究黄连解毒汤治疗UC潜在的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集黄连解毒汤中药物的主要有效成分,及有效成分的作用靶点,然后在GeneCards与OM...     

基于病证结合的中药复方治疗糖尿病机制

目的 基于病证结合思想探讨小陷胸汤、消渴丸、玉泉丸、杞菊地黄丸4个中药复方治疗糖尿病不同证候的分子学机制。方法 通过中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)获取方剂、疾病、证候的靶标,筛选核心靶点。利用DAVID平台进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用Cytoscape3.8.0软件构建疾病与证候靶点相结合的“中药-靶标-通路-证候-疾病”网络。结果 4个复方治疗糖尿病均涉及FoxO信号通路和c AMP信号通路,与细胞基本生理功能和能量转化相关。治疗痰热互结证涉及胰岛素抵抗等通路,与调节胰岛素和胰高血糖素分泌有关。肺热津伤证的治疗与抑制Measles等免疫炎症通路相关。玉泉丸通过PI3K-Akt信号通路等治疗气阴两虚型糖尿病。肝肾阴虚证的治疗通路主要为急性髓系白血病、子宫内膜癌、黑色素瘤等。结论 本研究以“态靶结合”和“病证结合”为主导思想,揭示了4个复方治疗糖尿病不同证候的多成分、多靶点、多通路的作用机制,诠释了方剂治疗糖尿病证候的科学内涵,为今后中药治疗糖尿病提供依据和参考。     

miRNA-494-3p靶基因预测及其相关信号通路的生物信息分析

目的采用生物信息学的方法对miRNA-494-3p的靶基因进行预测,并对靶基因集合进行功能富集分析和信号通路分析。方法应用微小RNA(miRNA)靶基因数据库StarBase进行靶基因预测,选取miRanda、PITA和Targetscan 3个数据库预测结果的交集作为进一步分析的基因集合。利用DAVID数据库,对靶基因进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果3个数据库预测到miRNA-494-3p的靶基因253个,其功能分别富集在蛋白质结合、双链DNA结合、RNA结合等分子功能,RNA聚合酶Ⅱ的转录调控、细胞增殖的正调控、细胞分化、细胞凋亡等生物学过程以及细胞核、核质、胞浆、细胞质、细胞隔膜等细胞组分上;生物学通路主要富集于癌症通路、FoxO信号通路、细胞吞噬作用、刺猬信号通路、细胞黏附连接、肌动蛋白细胞骨架的调控、谷氨酸能突触、昼夜节律以及p53信号通路中。结论miRNA-494-3p的功能主要富集在与癌症、胰岛素抵抗、糖尿病、炎症、胚胎发育等相关的多个信号通路中,为进一步研究其对靶基因和信号通路的调控作用及其可能的机制提供了线索。     

创新网络关系治理对科技型中小企业突破性创新的影响机理

创新网络关系治理、知识场活性在科技型中小企业突破性创新过程中发挥着至关重要的作用。以“网络-知识-创新”为逻辑框架,构建了创新网络关系治理、知识场活性与科技型中小企业突破性创新的概念框架及研究假设,通过大样本数据调查,运用区间数拓展DEMATEL、SmartPLS结构方程模型对概念框架进行了信效度检验和结构方程模型分析。结果显示,创新网络关系治理（共生行为、联结强度和影响策略）对知识场活性具有显著正向影响;知识场活性与科技型中小企业突破性创新之间具有显著正向关系。     

平台经济反垄断研究的热点演进与理论框架——基于文献计量方法的分析

平台经济是连接多个用户群体进行信息与资源交换的新型商业模式,近年来其垄断形势愈演愈烈,对现有监管模式和反垄断研究理论提出了新的挑战。文章利用Citespace V科学计量工具,对2003—2022年中国知网数据库中中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊的平台经济反垄断研究进行知识图谱可视化研究,在探究该领域的研究热点演化路径的基础上,构建了平台经济反垄断的理论框架。研究发现,平台经济反垄断研究主题经历了从传统双边产业反垄断与反垄断法构建,到双边市场特征与相关市场界定问题,到算法、大数据引发的垄断治理困境,再到超级平台形成、“二选一”独占交易协议4个阶段的演变。总的来看,平台经济反垄断理论框架由垄断形成机理、垄断演进趋势和反垄断规制体系三个部分组成。平台经济的规模效应、网络效应和锁定效应三种特征诱致垄断发生,垄断竞争理论、双边市场理论和产业组织理论是这一问题的重要研究视角;在技术与规模驱动下,平台经济呈现“厂商垄断-平台垄断-场域垄断”的主体变迁和“价格垄断-算法垄断-数据垄断”的形式升级;对此,应当构建价格监管、算法规制与数据治理相结合的综合规制体系。     

我国新兴技术研究动态监测分析

科技监测是科学技术管理活动的重要环节。以科学知识图谱为代表的信息可视化技术是近年来科技监测领域使用的一项重要前沿技术手段。通过科学知识图谱对新兴技术研究文献的监测,可以为工程技术及其相关管理和研究人员提供动态演化脉络和发展路径,为新兴技术开发提供重要的辅助决策基础。以科学计量学为基础,运用CiteSpace信息可视化软件对中国期刊全文数据库（CNKI）的文献数据进行分析,通过文献关键词共现网络图谱和关键词聚类分析结果,探索我国新兴技术研究不同阶段的研究主题及其动态演化过程,实现了对新兴技术研究文献的动态监测分析。最后,提出了新兴技术未来发展趋势和对策。     

公私合作伙伴关系（PPP）的文献计量与可视化分析

为了解国内PPP领域的研究现状和发展趋势,以CNKI数据库（2000-2015）收录的相关期刊论文为数据来源,运用SATI3.2和UCINET6.0软件,针对期刊、作者、机构和关键词字段进行文献计量和可视化分析,着重对关键词进行了社会网络分析、聚类分析和多维尺度分析。通过上述研究,得到了反映该领域研究的知识图谱,并由此发现该领域的主流期刊、高水平机构、代表性学者、知识特征和研究趋势。     

开放式创新平台组织采纳关键因素研究

运用技术-组织-环境框架与IT匹配理论等创新采纳理论,探索了组织采纳基于互联网开放式创新平台的关键因素及影响机制,揭示了开放式创新平台在组织中的采纳与扩散。运用探索性单案例研究方法,分析了影响开放式创新平台组织采纳的关键因素。研究发现,开放式创新平台的技术特质（相对优势、开放性、协同创新性、网络外部性）、组织情境（组织战略、高层支持、创新文化、组织规模）、外部环境（政策支持、外部压力）等因素对组织采纳决策具有直接影响作用。另外,技术特质与组织因素的匹配以及技术特质与环境因素的匹配不仅对采纳决策具有直接影响作用,而且对技术特质、组织情境、外部环境与采纳决策间关系发挥中介作用。     

国际新能源汽车科学知识网络结构及时空演变

作为战略性新兴产业,新能源汽车的发展需要不断获取和吸收新知识,科研合作为科学知识转移、扩散和共享提供了良好的平台。以2000-2015年新能源汽车领域合作论文作者的国别信息为数据源,从国家层面构建国际新能源汽车科学知识网络,运用社会网络分析方法对2000-2003年、2004-2007年、2008-2011年、2012-2015年4个阶段新能源汽车科学知识网络的拓扑结构、中心性、核心-边缘分布以及凝聚子群进行分析,探讨了科学知识网络时空演变的复杂性。     

IT环境下企业内部获取和运用会计信息的新构架

为了适应现代化管理决策层次化的需要,企业内部必须建立获取和运用会计信息的新构架:即建立基于数据仓库的,以数据库的联机分析处理技术和数据挖掘技术为实现手段,并以事项法为基础的高度集成的电算化会计信息系统;针对计算机网络环境下企业会计信息处理分散的特点,在企业内部建立基于客户机/服务器体系的分布式会计数据库结构。     

IT环境下企业内部获取和运用会计信息的新构架

为了适应现代化管理决策层次化的需要,企业内部必须建立获取和运用会计信息的新构架:即建立基于数据仓库的,以数据库的联机分析处理技术和数据挖掘技术为实现手段,并以事项法为基础的高度集成的电算化会计信息系统;针对计算机网络环境下企业会计信息处理分散的特点,在企业内部建立基于客户机/服务器体系的分布式会计数据库结构.     

服务创新管理研究前沿与热点知识图谱分析

应用共词共引方法,利用信息可视化软件CiteSpaceIII,对ISI “web of science”数据库中有关服务创新管理的文献数据进行网络图谱分析。结果显示,服务创新管理研究与技术创新、管理创新以及营销学研究更加融合;基于新兴IT技术的发展及应用,高技术服务创新是服务创新管理研究的主要领域;高技术服务创新的组织形式更多地表现为合作网络与平台化趋势,其中,制造业服务化、服务创新与技术创新融合、商业模式转型、动态能力以及创新绩效量化研究等主题备受关注。     

大学生就业能力国内研究的知识图谱分析

依据科学计量学基本原理,从知识图谱可视化研究角度出发,运用Bibexcel、Citespace等科学计量软件和信息可视化工具对中国学术期刊网络出版总库（CAJD）中2000～2012年大学生就业能力研究的数据进行了来源文献的相关统计分析以及关键词共现、作者共现、期刊来源等分析,并绘制出相应知识图谱,探讨了该研究领域中的基本研究情况、研究热点和研究趋势等。     

基于CiteSpace分析下的图书馆安全研究

文章运用CiteSpace软件对来源于CSSCI数据库的1998-2018年图书馆安全研究的文献中关键词、作者及作者与期刊被引情况进行可视化分析,发掘出高产作者和高被引作者及作者间的相互合作,认为研究前沿从数字图书馆、信息安全、网络安全等逐步向云计算和大数据转变且与计算机、网络、信息等方面越来越密切,且该研究最新的热点关注领域为大数据环境下带来的图书馆系列安全问题等。     

共享制造平台网络结构特征及影响因素研究

基于共享制造代表平台海织云平台,运用社会网络分析（SNA）探究共享制造平台网络结构特征,并使用二次指派程序（QAP）对共享制造平台网络的影响因素进行实证分析。研究发现：目前共享制造平台处于发展初期,网络规模不断扩大,但合作关系的紧密程度有待进一步加深。海织云等节点在网络中占据核心地位,拥有较大的权力和影响力,其他节点的权力地位也在逐步提升。凝聚子群分析表明共享制造平台中存在多个小团体,呈现多层次格局。QAP分析表明,共享制造平台合作网络受经济规模、地理邻近、知识邻近、社会邻近、组织邻近、制度邻近、政策强度和产业邻近等因素的影响。研究成果为制造企业更好地理解共享制造及为共享制造平台的发展提供帮助。     

创新网络空间格局形成机理及演化分析

针对创新网络空间格局如何形成及演化的问题,基于多元邻近视角剖析创新网络空间格局形成机理,运用Agent理论设计仿真算法,并基于Netlogo构建创新网络空间格局演化仿真平台。通过模拟实验发现：①多元邻近更有利于创新网络区域内、外部合作共生,且（跨区、内部）合作边数与区域面积、毗邻距离呈正、负相关;②社会邻近或技术邻近更有利于创新网络产生（绝对）空间集聚,且集聚态势与区域位置中心性呈正相关;③创新网络空间格局呈现随机型至斑块型（或均匀型）的动态演化趋势,且社会邻近或技术邻近更有利于创新网络产生均匀型空间格局,地理邻近或多元邻近更有利于创新网络产生斑块型空间格局;④地理因素作用下的创新网络（空间格局）仍保持幂律分布特性;⑤斑块型空间格局的创新绩效高于均匀型,且多元邻近下斑块型空间格局的创新绩效最高。