基于网络药理学探索黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的 运用网络药理学探讨黄连解毒汤治疗溃疡性结肠炎（UC）的主要有效成分,预测有效成分的作用靶点,建立“中药-成分-靶点-疾病”网络,再深入研究黄连解毒汤治疗UC潜在的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）收集黄连解毒汤中药物的主要有效成分,及有效成分的作用靶点,然后在GeneCards与OMIM数据库中获取UC相关靶点基因,将UC相关靶点基因与中药作用靶点取交集得到治疗UC的关键作用靶点,使用String数据库对关键作用靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并通过Cytoscape软件将结果可视化。最后使用David数据库对黄连解毒汤治疗UC的作用靶点进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 筛选黄连解毒汤主要有效成分84个,142个关键作用靶点,共富集148个生物学过程和功能、161条信号通路。结论 黄连解毒汤治疗UC是通过多靶点、多信号通路一起调节的复杂过程,最终起到治疗UC的作用。     

基于网络药理学探讨葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制

目的运用网络药理学方法揭示葛根芩连汤治疗放射性肠炎的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取葛根芩连汤有效成分及活性成分作用靶点;运用GeneCards数据库获取放射性肠炎疾病基因;将靶点和靶标基因取交集,获得关键靶点,用String数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。运用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共收集葛根芩连汤138个活性成分和8个关键作用靶点。GO富集分析和KEGG通路富集分析其主要机制是通过调控黏附斑激酶(FAK)及其信号通路,MAPK信号通路等信号通路,调节Th17细胞分化在放射性肠炎损伤修复中发挥损伤修复作用。结论葛根芩连汤治疗放射性肠炎可能影响了放射性肠炎的免疫微环境,并调控肠道炎症反应起到治疗作用。     

基于网络药理学分析中药广藿香抗菌作用机制和关键靶点

目的 探讨中药广藿香主要活性成分的抗菌作用机制和关键靶点。方法 首先从中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库中筛选出中药广藿香的主要有效成分及相应作用靶点,运用Uniprot数据库将其转化成相应的靶点基因,接着将经过筛选得到的广藿香主要活性成分与靶点基因导入至Cytoscape3.6.1软件中,绘制出广藿香主要活性成分-基因靶点网络图。结合Gene Cards数据库对广藿香发挥抗菌作用的相关靶点进行检索,随后将筛选得到的核心靶点基因上传至STRING平台,进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建,最后,应用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果 从广藿香中筛选出11个主要活性成分,可能的抗菌作用靶点1839个,包括AKT1、IL6、VEGFA、CASP3和JUN等。经PPI网络分析可以发现广藿香的主要活性成分与抗菌靶蛋白之间结合能力较强。通过对靶点的GO分析和KEGG通路富集分析可以发现生物过程模块主要参与对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、对营养水平的反应、氧化应激反应等过程;分子功能模块主要参与细胞因子受...     

基于网络药理学与分子对接分析都梁丸抗偏头痛的作用机制

目的运用网络药理学方法与分子对接技术探讨都梁丸抗偏头痛的分子作用机制。方法依据反向药效团匹配方法预测活性成分靶点信息,通过DrugBank、GeneCards、NCBI数据库对比筛选抗偏头痛靶点,通过Rv 3.5.1软件进行潜在靶点基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络图,通过String数据库获取蛋白相互作用,用Systems dock Web Site对其进行分子对接验证。结果网络药理学分析结果表明都梁丸中的活性成分可通过干预22个潜在靶点和调节肾素-血管紧张素系统、胰岛素抵抗、MAPK信号通路发挥抗偏头痛作用。分子对接结果中dockingscore>4.25占76%,说明活性成分与靶点之间有一定的结合活性。结论都梁丸可能通过“多成分-多靶点-多通路”调控MME、肾素-血管紧张素系统、激素受体等发挥抗偏头痛作用。     

基于病证结合的中药复方治疗糖尿病机制

目的 基于病证结合思想探讨小陷胸汤、消渴丸、玉泉丸、杞菊地黄丸4个中药复方治疗糖尿病不同证候的分子学机制。方法 通过中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)获取方剂、疾病、证候的靶标,筛选核心靶点。利用DAVID平台进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用Cytoscape3.8.0软件构建疾病与证候靶点相结合的“中药-靶标-通路-证候-疾病”网络。结果 4个复方治疗糖尿病均涉及FoxO信号通路和c AMP信号通路,与细胞基本生理功能和能量转化相关。治疗痰热互结证涉及胰岛素抵抗等通路,与调节胰岛素和胰高血糖素分泌有关。肺热津伤证的治疗与抑制Measles等免疫炎症通路相关。玉泉丸通过PI3K-Akt信号通路等治疗气阴两虚型糖尿病。肝肾阴虚证的治疗通路主要为急性髓系白血病、子宫内膜癌、黑色素瘤等。结论 本研究以“态靶结合”和“病证结合”为主导思想,揭示了4个复方治疗糖尿病不同证候的多成分、多靶点、多通路的作用机制,诠释了方剂治疗糖尿病证候的科学内涵,为今后中药治疗糖尿病提供依据和参考。     

基于网络药理学探讨桃仁-红花药对治疗膝骨性关节炎的作用机制

目的基于网络药理学的研究方法,探讨桃仁-红花药对治疗膝骨性关节炎(KOA)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards、OMIM等数据库检索药物、疾病的共同作用靶点,制作韦恩图;利用String数据库构建药物与疾病共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape3.7.2软件构建药物-成分-疾病-靶点网络;最后通过Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并将结果可视化。结果桃仁-红花药对治疗KOA的主要成分是槲皮素、beta-谷甾醇、山奈酚、木犀草素、黄芩素等;关键靶点为IL6、MAPK8、IL1B、MAPK1、JUN、VEGFA、PTGS2、CCL2、EGF、MMP2等;关键作用通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路、恰加斯病、肿瘤坏死因子信号通路、癌症的途径、HIF-1信号通路等。结论桃仁-红花药物有效成分通过多靶点,多通路产生抑制KOA内的炎症反应、成骨细胞的表达、软骨细胞凋亡等作用,进而达到治疗KOA的目的。     

低糖缺氧大鼠H9C2细胞中长链非编码RNA NR＿027324和miR-103-3p的表达及靶向调节关系验证

目的 探索在低糖缺氧的大鼠H9C2心肌细胞中,长链非编码RNA(lncRNA)NR＿027324和miR-103-3p的表达变化,以及lncRNA NR＿027324对miR-103-3p的靶向调节关系。方法 利用逆转录定量聚合酶链反应（qRT-PCR）法测定在低糖缺氧H9C2细胞中lncRNANR＿027324和miR-103-3p的表达变化。采用生物信息学的方法,预测H9C2细胞中NR＿027324序列上的miR-103-3p结合位点。将NR＿027324的3’UTR及点突变序列插入荧光素酶报告载体中,并分别与miR-103-3p类似物（miR-103-3p-mimic）或miR-103-3p类似物阴性对照（mimic-NC）,共转染293T细胞。48h后,通过双荧光素酶检测试剂盒,检测荧光素酶的活性,确定NR＿027324与miR-103-3p的靶向关系。通过进一步质粒转染过表达和RNA干扰技术,分别上调和下调H9C2细胞中NR＿027324的表达,验证miR-103-3p表达变化。结果 低糖缺氧H9C2细胞中,NR＿027324表达量明显上调,miR-103-3p表达量下降,A...     

传统聚落景观基因胞的生物特征研究

“景观基因胞”概念原指传统城镇景观的基本单元，是对有机体细胞的类比，所有聚落建筑、构筑物其实都可以看成形态、功能不一的细胞单元，它们共同协作构成聚落文化景观有机整体。文章延续这一概念，并继续与生物细胞的生物学特征进行类比。研究认为，景观基因胞具有如下生物学特征：代谢活动；增殖与凋亡；遗传与变异。其中，代谢活动包括空间代谢、物质代谢与功能代谢，遗传方式包括胞扩散、胞变异与胞恒定三种方式。最后，文章选取湘东北及湘东南三个传统聚落——张谷英村、中田村以及上甘棠村，对景观基因胞生物学特征的表达方式进行案例诠释。     

美国生物科技发展概述

随着计算技术/生物信息学、纳米技术、通信/多媒体技术、生物/化学/药物等多学科的研究积累,系统生物学正在得到迅速发展。生物科技的发展比期望快:RNAi(核糖核酸干扰现象,具有特异降解RNA片段功能的RNA片段)、全基因扫描、干细胞、药物投放等基础研究更加成熟,技术手段进步,研究的复杂性和集成度不断增强:由原来的“基因→细胞→系统→药物”的模式转到“基因组→蛋白质组→代谢机理→毒理”模式,系统性和对象规模都要提高若干量级。经过多学科的综合交叉作用,系统生物学应运而生。系统生物学以全基因生物学的观点进行研究,用集成的观…     

基于网络药理学和分子对接技术分析柴胡-白芍药对治疗肝损伤的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡-白芍药对治疗肝损伤（LI）的作用机制。方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）以口服生物利用度（OB）≥0.30且类药性（DL）≥0.18为条件筛选得到柴胡-白芍药对的活性成分化合物及对应靶点,运用Pubchem平台获取靶点Canonical SMILES号,通过SwissTargetPrediction及TargetNet数据库预测并获取有效靶点;运用GeneCards及OMIM数据库获取LI疾病基因靶点;Venn2.1平台进行拓扑分析,获取疾病与活性成分的交集靶点;将交集靶点导入String数据库,获取蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,靶点网络以PPI阈值0.9为标准,隐藏游离靶点,下载PPI可视化图和交集靶点.TSV文件;运用Excel建立“药物-活性成分-靶点”表,导入Cytoscape 3.9软件构建关系网络,并进行可视化;运用DAVID数据库将柴胡-白芍药对治疗LI的作用靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,获取数据,并利用微生信数据可视化平台进行可视化。根据Degree值运...     

基于景观基因完整性理念的传统聚落保护与开发

历史文化聚落保护与开发的问题是规划界长期困扰的问题.这些古聚落要实现自身的可持续发展,必须从景观基因的"点-线-网-面-体"等五个方面进行综合考虑,以确保聚落景观基因的完整性.以此为出发点,可以从摸清古聚落基因家底、准确定位价值、展示景观基因、构建完整的景观基因体系、加强配套措施等方面开展相应工作.     

日本生物技术的主要研究领域

2003财政年度日本政府预算总额为81.79万亿日元,比上年度增加0.7%,其中与科技有关预算为3.59万亿日元,比上年度增加1.3%。按照日本第二个《科学技术发展五年基本计划》,生命科学及生物技术仍然为重点发展领域之首。日本生物技术的主要研究领域如下:1.紧紧抓住人类基因组测序完成的机会,全力抢攻功能基因,开展个性化医疗和再生医疗的战略性研究。日本在人类基因组测序中虽然只承担了6%的任务,但是在后基因的研究上正在全力以赴。在个性医疗方面,其主要的研究方向为:通过单核酣酸多态性研究,确定与癌症、糖尿病等各种疾病相关的基因,从而在解…     

知识基因视角下科技成果转化影响因素研究

为梳理科技成果转化具体环节，探索影响科技成果转化的关键因素，引用知识基因理论，类比知识基因遗传和表达，提出知识基因视角下科技成果转化需要的四大基本要素：科技DNA、科技RNA、酶和科技性状，并将科技成果转化过程划分为识别、转录、翻译、组合、扩散5个阶段，在此基础上构建科技成果转化评价指标体系，以2016-2020年中国内地30个省域面板数据为样本进行实证检验。通过灰色关联度计算和障碍因子识别发现：(1)2016-2020年各指标与科技性状表达的关联程度和障碍强度较为稳定；(2)各指标与显性科技性状表达的关联程度更紧密，翻译阶段与显性科技性状表达关联度最高，转录要素酶与隐性科技性状表达关联度最高；(3)不同省份之间影响科技性状表达的主要因素具有显著差异；(4)组合活动和翻译活动开展情况是制约我国科技成果转化的主要障碍因子。     

系统遗传学与生物技术-细胞分子生物系统的分析与合成刍议

探讨系统遗传学与生物技术-细胞分子生物系统的合成。系统生物工程、合成生物学都是以数学模型、系统科学为基础,采用生物系统原理,进行基因信息系统、人造工程生物体、仿生人工机器硬件、虚拟计算机信息软件等系统的设计。细胞通过分化作用构成四维时空分化的基因表达谱。系统科学对计算机科学、人工机器的仿生学的理论有着重要意义,可推广使用。     

抗衰老研究

现代生物学已进入分子生物学时代,所以抗衰老研究涉及到生物钟的寻找和定位、基因分析、细胞化学等多个领域。现将目前的研究进展简介如下,供读者参考。 1.染色体端粒研究 Hayflick的实验表明细胞分裂是有限度的,可是细胞不分裂后为什么会死呢?癌细胞为什么可以一直分裂下去而不死亡呢?遗传学家发现一个现象,细胞每分裂一次,染色体的端粒,即位于染色体顶端的部分,就短一点,分裂继续下去,端粒就越来越短,     

人PD-L1蛋白的预测及分析

目的采用生物信息学方法预测PD-L1蛋白的结构及功能。方法在UniProt数据库中获取人PD-L1蛋白的氨基酸序列;运用ProtParam及ProtScale预测人PD-L1蛋白的理化性质及亲疏水性;应用TMHMM分析人PD-L1蛋白的跨膜区;分别利用SOPMA及Swiss-Model分析人PD-L1蛋白的二级结构并建立三级结构模型;利用STRING、蛋白同源性预测网站及信号肽预测服务器预测与人PD-L1蛋白相互作用蛋白、PD-L1蛋白的同源性以及是否有信号肽。结果人PD-L1蛋白有290个氨基酸,等电点为6.76,有信号肽,蛋白质具亲水性且高度保守;二级结构推测无规则卷曲是人PD-L1蛋白最大量的二级结构原件,而α-螺旋和延伸链散布于整个蛋白中;Swiss-Model预测了5种三级结构模型;人PD-L1蛋白的相互作用蛋白可能参与并影响细胞信号转导功能。结论人PD-L1蛋白是PD-1的关键配体蛋白,生物信息学预测其属跨膜蛋白,其对肿瘤的发生、发展以及免疫细胞的功能具有重要影响。     

中国消费者信心与消费需求拉动效应的实证分析

美英等国的消费者信心指数(CCI)可预测消费者的行为,也可为宏观经济提供信号传导功能。应用格兰杰因果检验与回归分析,笔者对我国 CCI 与京、津、沪、穗四大城市的社会消费品零售总额之间的关系进行了实证检验。结果表明：我国 CCI 与北京、天津的消费需求存在显著的预测和单向信号引导关系,与上海、广州的消费需求不存在显著因果关系。     

35例恶性肿瘤患者淋巴细胞Ag-NORs检测分析

目的细胞核仁形成区(NORs)由核糖体RNA基因组成,位于此区调控rRNA转录的酸性非组蛋白可被硝酸银染色(Ag-NOR),肿瘤细胞中Ag-NOR数目、分布和强度可作为肿瘤诊断、细胞分型和分化分级的重要指标。由于肿瘤细胞相关分子等的毒性作用,患者淋巴细胞NORs区的酸性非组蛋白得以表达。有别于非恶性疾病,并以此进行肿瘤诊断和病情监测。方法北京健尔康医疗设备有限公司提供的KL型肿瘤免疫图像分析系统,5%硝酸银及相应的银染试剂,RPMI1640培养液,普通细胞银染技术对患者外周血淋巴细胞染色。选择35例恶性肿瘤患者及35例健康对照者,经培养、制片、银染、图像分析四个步骤,计算T淋巴细胞核银染面积与细胞面积比值(即I.S%值)。结果对70例正常者和各种肿瘤患者的淋巴细胞酸性非组蛋白表达活性进行了对比研究,发现恶性疾病与正常者之间有明显差异。35例肿瘤患者中有28例阳性结果,有统计学意义,说明I.S%阳性结果与肿瘤有较密切联系,但并无特异性,这与有关文献报道相符。结论外周血T淋巴细胞Ag-NORs检测,可作为恶性肿瘤诊断及病情监测的重要参考指标。     

文化生态学视角下佛山古村八景的“地域 性”解读

：在乡村振兴战略背景下，探究古村落地域性的传统 文化景观基因及其内生机制对于推进古村落的有效保护与活 化意义重大。集佛山14个古村“八景”文本，引入文化生态 学理论和“四层一体”的古村落分析方法，透过景观元素的 析取与分析发现：“八景”集合是一个完整的地域性文化生 态系统，既表征了地域性文化基因，又自成体系，且与环境 “互适”发展。这启示我们：古村落的保护当以整体性为原 则，其活化实践当兼顾自然生态、乡村产业、村民组织与乡 村文化的协同发展。     

帕博利珠单抗用于治疗非小细胞肺癌的药物经济学评价文献综述

目的 综述帕博利珠单抗治疗非小细胞肺癌研究的评价方法及结果,为提高我国帕博利珠单抗相应经济学评价质量提供参考。方法 利用计算机检索中国期刊全文数据库、中文期刊全文数据库、万方数据知识服务平台、PUBMED、The Cochrane Library、Ovid Embase等中英文数据库,检索各数据库建库至2021年12月帕博利珠单抗经济性评价研究文献。按纳入排除标准筛选文献后提取信息,使用CHEERS质量评价表评估纳入文献质量,并对纳入文献的基本信息、模型、效用值、成本来源以及经济性研究结果进行描述性分析。结果 本研究共纳入7篇文献,目前帕博利珠单抗治疗非小细胞肺癌研究模型多采用马尔可夫模型与分区生存模型,多采用成本-效果分析、成本-效用分析两种方法。研究角度包括卫生体系、医疗保障支付方、国家卫生服务体系三个角度,因此成本主要考虑直接医疗成本,成本数据来源于米内网、药智网、KETNOTE-042等公开发表的资料等。效果值、效用值均使用质量调整生命年（quality-adjusted life years, QALYs）作为远期健康获益指标,数据来源于公开发表的资料。5篇文献结果显示帕博利...