对方证据不足，法院为什么判我们败诉？

我公司是一家建筑公司，2002年因工程需要从某建材公司购买了一批乳胶，但是，因该乳胶存在质量问题，我公司就通知该建材公司要求退货。但是，该公司以乳胶质量没有问题为由对我公司的退货要求置之不理，至使该批乳胶在我公司仓库存放达二年之久。但是，我公司并没有对该批乳胶质量进行鉴定。2004年6月，该公司以我公司拖欠货款为由将我公司诉至法院。在法庭上，我公司只是承认有购买乳胶的事实，但是对该公司出具的证据没有认可。