小麦醇溶蛋白序列的分子生物信息学分析

从NCBI蛋白数据库中选取10条有代表性的小麦醇溶蛋白序列,利用Protparam分析理化性质、用Clustalw软件在线构建多序列对比和系统进化树、用MEMEprogram3软件在线分析醇溶蛋白的类型和排列顺序、用PSIPREDversion3.3软件在线预测醇溶蛋白的二级结构、域结构和折叠域识别。结果表明:醇溶蛋白的平均疏水指数均为负值,为亲水性蛋白质;醇溶蛋白的不稳定系数均大于40,属于不稳定蛋白质;多序列比对发现醇溶蛋白均含有P(Pro)和Q(Gln),且重复出现率较高;对10条醇溶蛋白序列系统进化树构建可以看出α/β-和ω-醇溶蛋白的同源性较近,与γ-醇溶蛋白同源性较远;醇溶蛋白均含有基序Motif 1、Motif 2、Motif 3和Motif 4,这些域结构可能在维持醇溶蛋白结构和功能方面有重要作用;醇溶蛋白的二级结构由α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲等结构组成,α/β-和γ-醇溶蛋白中α-螺旋且含量较多,且结构有序,而ω-醇溶蛋白中α-螺旋含量较少,而结构混乱无序。