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成体舌形贝(Lingula Bruguire)的MicroRNA表达检测与分析
作者姓名:孔亮  陆祖宏
作者单位:东南大学生物科学与医学工程学院
摘    要:腕足动物门(Brachiopoda)是最古老的Body plan之一,最早发现于早寒武世,繁盛于志留、泥盆二纪,其后延续至今[1-3]。多数腕足动物类群现已灭绝,舌形贝(Lingula Bruguire)是仅存的现生腕足动物之一。本文在Halanych等最新腕足动物分类标准的大前提下[3],以Lingula Bruguire为研究对象,通过microRNA谱的特征分析[4],探索原口动物与后口动物共同祖先(Protostome-deuterostome ancestor,PDA)的microRNA祖征(Plesiomorphy)状态[5]。本研究中,我们首先提取成体Lingula Bruguire的总RNA,然后以标准方法特异性提取其中的总MicroRNA,运用东南大学自主研发的AG-100高通量测序平台和ABI Solid 3.0测序系统,检测成体Lingula Bruguire的microRNA表达状态。在此基础之上,运用现代生物信息学手段,结合MiRBase现有数据,逐级分析现生触手冠类群(Lophophorata)、冠轮动物(Lophotrochozoa)和所有两侧对称动物(Bilateria)的microRNA分布关系,推测出PDA基因组可能拥有let-7、miR-10、miR-133、miR-184和miR-92等5个microRNA,为研究microRNA在真后生动物(Eumetazoa)亿万年演化历程中的相关变化提供研究基础。

关 键 词:舌形贝  microRNA  腕足动物门  早寒武世  演化生物学
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