| 生物序列局部比对的快速算法 |
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| 引用本文： | 袁媛.生物序列局部比对的快速算法[J].嘉兴学院学报,2006,18(3):66-68. |
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| 作者姓名： | 袁媛 |
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| 作者单位： | 嘉兴学院数学与信息科学学院,浙江嘉兴,314001 |
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| 摘 要： | 给出了一个可适用于大规模的、非同源的两两生物基因组序列局部比对的快速比对算法SLA，该算法在运算时间上优于已有的局部比对软件包：chaos．
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| 关 键 词： | 序列的局部比对 算法 基因组 |
| 文章编号： | 1008-6781（2006）03-0066-03 |
| 收稿时间： | 2005-12-01 |
| 修稿时间： | 2005年12月1日 |
Fast Local Alignment Algorithm for Biosequence |
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| YUAN Yuan.Fast Local Alignment Algorithm for Biosequence[J].Journal of Jiaxing College,2006,18(3):66-68. |
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| Authors: | YUAN Yuan |
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| Institution: | School of Mathematics and Information Science, Jiaxing University, Jiaxing Zhejiang 314001 |
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| Abstract: | In this paper, we introduce the SLA (Super Local Alignment) , the algorithm to create local a-lignment of divergent genomic DNA sequences. SLA is much faster while keeps the same or better performance, comparing with the existing tool: chaos. |
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| Keywords: | local alignment fast alignment algorithm genomic sequence |
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